Природные зоны Башкортостана определяют богатство фауны республики, большинство видов встречаются в аналогичных зонах Европы и Сибири. На его территории обитает 76 видов млекопитающих, более 300 видов птиц, 47 видов рыб, 10 видов пресмыкающихся и 10 видов земноводных.В лесах республики обитают бурые медведи, рыси, косули, бурундуки, белки, волки. Из птиц здесь встречаются кукушки, совы, дятлы, голуби. Также в лесах живут некоторые виды змей и ящериц.В степной зоне встречаются волки, зайцы, сурки, тушканчики, хомяки, хорьки, степная гоадюка, дрофы, стрепеты.Особенно богат животный мир водных объектов. В водах и на берегах рек и озер Башкирии живут бобры, ондатры, водяные крысы, выдры, гагары, чайки, журавли, гуси, лягушки, жабы, болотные черепахи, десятки видов рыбы и 121 вид моллюсков.В Башкортостане обитает множество видов редких животных: марал, ушастый еж, выхухоль, сапсан, черный гриф, орлан-долгохвост, серая куропатка, гребенчатый тритон, прудовая лягушка, безногая ящерица, серый уж, болотная черепаха.Степная гадюка и узорчатый полоз — животные, которые встречаются только на территории южной части Башкортостана.