1м3 воздуха у поверхности Земли весит 1290 г , на высоте 12 км - 319 г , на высоте 40 км - 4 г .Как объяснить эти факты ?

Это объясняется разостью давлния на разных высотах.

скорее всего, это связано с плотностью воздуха на разных высотах, т. е. плотность воздуха становится меньше с высотой. и известно, что зависимость плотности вещества прямо пропорциональна его массе, чем больше плотность, тем больше масса вещества.